Nykyään suositeltavin tapa tunnistusmerkitä lemmikki on mikrosirutus. Mikrosirutus tarkoittaa sitä että lemmikin kaulalle vasemmalle puolelle ihon alle asetetaan pieni, hieman riisinjyvää suurempi kappale jossa on valmiiksi ohjelmoituna kullekin lemmikille ”henkilökohtainen” numerosarja. Siru asetetaan nahan alle neulalla, joka on hieman rokotusneulaa suurempi. Useat koirat ja kissat, olivatpa sitten pentuja tai aikuisia eivät reagoi sirun laittamiseen millään tavalla. Toiset reagoivat lyhytaikaiseen kipuun lievästi. Erittäin harvat lemmikit joudutaan sirutusta varten rauhoittamaan. Sirua vastaava numerosarja merkitään sen jälkeen lemmikin mahdolliseen rekisteri- tai rokotuskirjaan. Koirien tiedot lähetetään Suomen kennelliiton ja kissojen tiedot Suomen kissaliiton tietokantaan joka arkistoi tiedot. Jos lemmikki katoaa, voidaan mikrosirun tietojen perusteella löytää sen omistaja. Koiranäyttelyissä tai -kokeissa käyville koirille, siitokseen käytettäville kissoille tai ulkomailla matkustaville lemmikeille tunnistusmerkintä on pakollinen. Vuoden 2009 alusta Suomen kennelliitto edellyttää että kaikki rekisteröitävät koiranpennut ovat tunnistusmerkittyjä.
